Российские распределенные вычисления на платформе BOINC
Форум участников распределённых вычислений.

Добро пожаловать, Гость! Чтобы использовать все возможности Вход или Регистрация.

Уведомление

Icon
Error

Опции
К последнему сообщению К первому непрочитанному
Offline Step  
#1 Оставлено : 8 марта 2013 г. 7:55:58(UTC)
Step


Статус: Старожил

Медали: Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member
Зарегистрирован: 03.08.2010(UTC)
Сообщений: 916
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Кирово-Чепецк

Сказал «Спасибо»: 288 раз
Поблагодарили: 236 раз в 165 постах
NanoModeling@HOME
Организаторы отечественные. Сайт проекта не робит. sad
Описание с украинского сайта distributed.org.ua:
Цитата:
NanoModeling@Home — это проект распределенных вычислений для конструирования наноструктур и нанороботов. Наша цель - молекулярное моделирование систем направленной доставки лекарств, нанороботов и связанных с ними наноструктур. Поскольку моделирование многочисленных комбинаций молекулярных взаимодействий требует гигантских вычислительных мощностей, эффективно распределение вычислений между компьютерами участниками проекта. Мы просим всех, кто стремится приблизить будущее, в котором не будет болезней и старости, присоединиться к проекту – и запускать NanoModeling@Home на машинах, которыми Вы владеете или с разрешения владельца. Настоящий проект организован и поддерживается частной группой энтузиастов в общенаучных интересах.
Команда проекта:
• Руководитель проекта - Кухарев Вадим
• Главный разработчик проекта - Демин Евгений
• Администратор сервера - Армеев Григорий
• Научный консультант - Шайтан Алексей
• Консультант - Скрыпник Ксения
• Тех.консультант - Стребуляев Александр
По вопросам и предложениям, связанным с NanoModeling@Home просьба писать по адресу vadim.kukharev @ gmail.com

Может письмецо им накалякать? 199

Отредактировано пользователем 8 марта 2013 г. 11:57:56(UTC)  | Причина: Не указана

UserPostedImage UserPostedImage
Наука — лучший способ удовлетворения личного любопытства за государственный счёт.
thanks 6 пользователей поблагодарили Step за этот пост.
hoarfrost оставлено 08.03.2013(UTC), vk_DiMoH оставлено 08.03.2013(UTC), Deberian оставлено 08.03.2013(UTC), evatutin оставлено 08.03.2013(UTC), PinkPony оставлено 08.03.2013(UTC), Freddykrug оставлено 09.03.2013(UTC)
Offline AlexA  
#2 Оставлено : 8 марта 2013 г. 9:00:18(UTC)
AlexA


Статус: Administration

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайта

Группы: Editors, Member, Administration, Russia Team Group, Moderators
Зарегистрирован: 02.10.2007(UTC)
Сообщений: 6,139
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: "Russia Team"

Сказал «Спасибо»: 1249 раз
Поблагодарили: 1515 раз в 837 постах
Автор: Step Перейти к цитате

Может письмецо им накалякать? 199

Накалякал smile

thanks 1 пользователь поблагодарил AlexA за этот пост.
Step оставлено 08.03.2013(UTC)
Offline Deberian  
#3 Оставлено : 8 марта 2013 г. 10:59:56(UTC)
Deberian


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 04.01.2011(UTC)
Сообщений: 1,113
Откуда: Ростов-на-Дону

Сказал(а) «Спасибо»: 163 раз
Поблагодарили: 90 раз в 74 постах
радует, что ещё один "живой" российский проект, тем более биологический факультет под флагом МГУ


Добро пожаловать!

Группа молекулярного моделирования существует в рамках кафедры биоинженерии Биологического факультета Московского Государственного Университета имени М.В. Ломоносова.

Мы занимается разработкой и применением современных методов компьютерного моделирования (молекулярная динамика, квантовая химия, гибридные методы QM/MM, методы молекулярного докинга, крупнозернистое моделирование) для исследования биологических и нано систем на молекулярном уровне. Подробнее о молекулярном моделировании и его возможностях смотрите здесь.


Они вон GPU кластер собрали:

GPUSIM HPC Cluster

GPUSIM - это гибридный кластер, сомещающий возможности традиционных и графических процессоров.

На данный момент он состоит из:

3 x Вычислительный сервер T-Platforms Twin Dexus 1U с 2 intel Xeon X5550 2.4 GHz процессорами и 12 GB оперативной памяти
2 x NVIDIA Tesla 1U S1070
Infiniband Switch: Mellanox InfiniBand MTS3600Q-1UNC
Ethernet Switch: D-link DGS-1248T/GE

По результатам теста LINPACK GPUSIM получил следующие результаты:

максимальная производительность на CPU 443 ГФлопс (см. LINPACK log)
максимальная производительность на GPU (с двойной точностью) 230.6 ГФлопс (см. LINPACK log)
Суммарная производительность 673.6 ГФлопс
Боец невидимого фронта ::::: Deberian
Нажми на кнопку - получишь результат !Reset>>>
thanks 1 пользователь поблагодарил Deberian за этот пост.
Step оставлено 08.03.2013(UTC)
Offline vk_DiMoH  
#4 Оставлено : 8 марта 2013 г. 11:28:25(UTC)
vk_DiMoH


Статус: Интересующийся

Группы: Member
Зарегистрирован: 27.08.2011(UTC)
Сообщений: 82
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: Санкт-Петербург

Сказал «Спасибо»: 426 раз
Поблагодарили: 24 раз в 15 постах
Как к нему подключиться?
Offline Step  
#5 Оставлено : 8 марта 2013 г. 11:55:23(UTC)
Step


Статус: Старожил

Медали: Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member
Зарегистрирован: 03.08.2010(UTC)
Сообщений: 916
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Кирово-Чепецк

Сказал «Спасибо»: 288 раз
Поблагодарили: 236 раз в 165 постах
Автор: Deberian Перейти к цитате
радует, что ещё один "живой" российский проект, тем более биологический факультет под флагом МГУ

Только он чегой-то не очень "живой", к сожалению. sad
Автор: AlexA Перейти к цитате
Накалякал smile

Подождём, что ответят.

UserPostedImage UserPostedImage
Наука — лучший способ удовлетворения личного любопытства за государственный счёт.
Offline AlexA  
#6 Оставлено : 8 марта 2013 г. 13:39:30(UTC)
AlexA


Статус: Administration

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайта

Группы: Editors, Member, Administration, Russia Team Group, Moderators
Зарегистрирован: 02.10.2007(UTC)
Сообщений: 6,139
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: "Russia Team"

Сказал «Спасибо»: 1249 раз
Поблагодарили: 1515 раз в 837 постах
Автор: Step Перейти к цитате
Автор: Deberian Перейти к цитате
радует, что ещё один "живой" российский проект, тем более биологический факультет под флагом МГУ

Только он чегой-то не очень "живой", к сожалению. sad
Автор: AlexA Перейти к цитате
Накалякал smile

Подождём, что ответят.


Вот вам ответ:
Цитата:
Александр, день добрый.

Спасибо за форум,
вот только проект и в самом деле стал не совсем живым.

Дело в том, что мы до сих пор работаем над алгоритмической постановкой
задачи мат.моделирования наноробота, это непросто (с наскоку не решили),
плюс катастрофически не хватает времени по ряду причин.

Как только (если только) ситуация изменится - напишу.

P.S. кстати, если у Вас есть алгоритмы (или даже исходники),
которые использовались в других BOINC-проектах, ориентированных на
молекулярное моделирование и поиск новых лекарств - просьба также написать.

с уважением
Вадим Кухарев

так что если вдруг кто-то чего-то может предложить - пожалуйста.

thanks 4 пользователей поблагодарили AlexA за этот пост.
SerVal оставлено 08.03.2013(UTC), vk_DiMoH оставлено 08.03.2013(UTC), Deberian оставлено 08.03.2013(UTC), Freddykrug оставлено 09.03.2013(UTC)
Offline Step  
#7 Оставлено : 8 марта 2013 г. 14:13:12(UTC)
Step


Статус: Старожил

Медали: Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member
Зарегистрирован: 03.08.2010(UTC)
Сообщений: 916
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Кирово-Чепецк

Сказал «Спасибо»: 288 раз
Поблагодарили: 236 раз в 165 постах
У группы исследователей есть неплохой сайт.
И, судя по каналу на Ютубе, товарищи в предмете разбираются лучше нас всех вместе взятых, так что врядли мы им можем чем-то помочь. sad
Цитата:
Компьютерное моделирование в приложении к предсказанию биологической активности молекул особенно эффективно, если имеются сведения о структуре лиганда и рецептора, взаимодействие которых и ответственно за определённый биологический отклик.

Исходя из этого, для каждой задачи будет свой алгоритм, в зависимости от того, какие есть исходные данные, что мы ищем и какой метод (докинг, скрининг, шмининг и пр.) используем.
Молекулярное моделирование Х.Д.Хёльтье, В. Зиппль, Д. Роньян, Г. Фолькерс
Надо им с коллегами из других институтов (например, EGEE) зафрэндиться - может поделятся чем-нибудь стоящим.
UserPostedImage UserPostedImage
Наука — лучший способ удовлетворения личного любопытства за государственный счёт.
Offline Deberian  
#8 Оставлено : 8 марта 2013 г. 19:59:08(UTC)
Deberian


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 04.01.2011(UTC)
Сообщений: 1,113
Откуда: Ростов-на-Дону

Сказал(а) «Спасибо»: 163 раз
Поблагодарили: 90 раз в 74 постах
Автор: AlexA Перейти к цитате


P.S. кстати, если у Вас есть алгоритмы (или даже исходники),
которые использовались в других BOINC-проектах, ориентированных на
молекулярное моделирование и поиск новых лекарств - просьба также написать.

с уважением
Вадим Кухарев

так что если вдруг кто-то чего-то может предложить - пожалуйста.



интересные ребята, а сами к другим проектам что ли не могут обратиться...
Боец невидимого фронта ::::: Deberian
Нажми на кнопку - получишь результат !Reset>>>
Offline evatutin  
#9 Оставлено : 9 марта 2013 г. 12:51:07(UTC)
evatutin


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@homeРазработчику: За организацию проекта Gerasim@home

Группы: Editors, Member
Зарегистрирован: 08.06.2010(UTC)
Сообщений: 3,622
Откуда: Russia, Kursk

Сказал(а) «Спасибо»: 1015 раз
Поблагодарили: 1788 раз в 874 постах
Deberian
Зачастую бывает очень полезно, когда сам что-то искал, а тут вдруг человек со стороны возьмет и подкинет очень интересную идею. Так что они правильно предлагают помочь smile

kvt.kurskstu team founder
Gerasim@home scientist
My numbers are 5056994653507584 and 1835082219864832081920. Why not? smile
Offline Deberian  
#10 Оставлено : 9 марта 2013 г. 13:15:10(UTC)
Deberian


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 04.01.2011(UTC)
Сообщений: 1,113
Откуда: Ростов-на-Дону

Сказал(а) «Спасибо»: 163 раз
Поблагодарили: 90 раз в 74 постах
Автор: evatutin Перейти к цитате
Deberian
Зачастую бывает очень полезно, когда сам что-то искал, а тут вдруг человек со стороны возьмет и подкинет очень интересную идею. Так что они правильно предлагают помочь smile


это я таки понимаю, но единственное, что могу сказать по сравнению с нанотехнологиями - более перспективна тема флептомеханики wink mrgreen
Боец невидимого фронта ::::: Deberian
Нажми на кнопку - получишь результат !Reset>>>
Offline Freddykrug  
#11 Оставлено : 9 марта 2013 г. 16:42:28(UTC)
Freddykrug


Статус: Старожил

Группы: Member, Модератор Astronomy.Ru Forum
Зарегистрирован: 30.05.2010(UTC)
Сообщений: 2,874
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Томск

Сказал «Спасибо»: 740 раз
Поблагодарили: 494 раз в 313 постах
То есть проект можно будет считать на видеокартах? И на каких? Хотя, если у них на сервере Tesla стоит, то радеоновцы спокойно идут лесом? sad
3 Gb Radeon 7950, i-5 2400, 16 Gb ОЗУ Astronomy.Ru Forum

Offline Deberian  
#12 Оставлено : 9 марта 2013 г. 16:48:23(UTC)
Deberian


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 04.01.2011(UTC)
Сообщений: 1,113
Откуда: Ростов-на-Дону

Сказал(а) «Спасибо»: 163 раз
Поблагодарили: 90 раз в 74 постах
Автор: Freddykrug Перейти к цитате
То есть проект можно будет считать на видеокартах? И на каких? Хотя, если у них на сервере Tesla стоит, то радеоновцы спокойно идут лесом? sad


не факт, судя по ответу. им некогда . нет времени и т.д., а этот кластер с Теслами я понимаю так - освоили проект, отчитались, даже в интурнете выложили флопсы ))

печалька )
Боец невидимого фронта ::::: Deberian
Нажми на кнопку - получишь результат !Reset>>>
Offline hoarfrost  
#13 Оставлено : 10 марта 2013 г. 14:42:57(UTC)
hoarfrost


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайтаРазработчику: За разработку приложения CluBORunДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Editors, Member, Administration, Moderator Crystal Dream, Moderators, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 05.10.2007(UTC)
Сообщений: 8,380
Мужчина
Откуда: Crystal Dream

Сказал «Спасибо»: 1236 раз
Поблагодарили: 1690 раз в 1072 постах
Tesla у них (как и CPU) - довольно старые. Скорее их кто-то подарил "с барского плеча".
UserPostedImage
Offline Deberian  
#14 Оставлено : 10 марта 2013 г. 16:23:32(UTC)
Deberian


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаДонор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 04.01.2011(UTC)
Сообщений: 1,113
Откуда: Ростов-на-Дону

Сказал(а) «Спасибо»: 163 раз
Поблагодарили: 90 раз в 74 постах
Автор: hoarfrost Перейти к цитате
Tesla у них (как и CPU) - довольно старые. Скорее их кто-то подарил "с барского плеча".


hoarfrost я же и говорю, "освоили" бюджет smile
Боец невидимого фронта ::::: Deberian
Нажми на кнопку - получишь результат !Reset>>>
Offline Disel  
#15 Оставлено : 24 ноября 2013 г. 6:41:54(UTC)
Disel


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Нахождение пар ОДЛК в RakeSearch! Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Russia Team Group
Зарегистрирован: 08.07.2013(UTC)
Сообщений: 3,594
Мужчина
Российская Федерация

Сказал «Спасибо»: 516 раз
Поблагодарили: 426 раз в 326 постах
Только что обратил внимание на эту тему. Жаль, что проект пока не заработал, присоединился бы.
Ubuntu Linux 18.04 LTS - 64 bit / Boinc 7.9.3(х64) / Core 2 DUO E6300 1.8 Ггц / GeForce GT-630
Offline Melter163  
#16 Оставлено : 24 ноября 2013 г. 9:14:45(UTC)
Melter163


Статус: Частенько заглядывает

Группы: Member
Зарегистрирован: 04.02.2013(UTC)
Сообщений: 276
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: Самара

Сказал «Спасибо»: 105 раз
Поблагодарили: 30 раз в 22 постах
Эх, надеюсь в скором времени заработает проект. Интересный чёрт возьми и полезный, тем более отечественный
Offline AlexA  
#17 Оставлено : 24 ноября 2013 г. 10:29:07(UTC)
AlexA


Статус: Administration

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайта

Группы: Editors, Member, Administration, Russia Team Group, Moderators
Зарегистрирован: 02.10.2007(UTC)
Сообщений: 6,139
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: "Russia Team"

Сказал «Спасибо»: 1249 раз
Поблагодарили: 1515 раз в 837 постах
Автор: Melter163 Перейти к цитате
Эх, надеюсь в скором времени заработает проект. Интересный чёрт возьми и полезный, тем более отечественный

Хорошо, что напомнили. Написал с вопросами, может что-то прояснится.

Offline AlexA  
#18 Оставлено : 24 ноября 2013 г. 20:02:26(UTC)
AlexA


Статус: Administration

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайта

Группы: Editors, Member, Administration, Russia Team Group, Moderators
Зарегистрирован: 02.10.2007(UTC)
Сообщений: 6,139
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: "Russia Team"

Сказал «Спасибо»: 1249 раз
Поблагодарили: 1515 раз в 837 постах
Автор: AlexA Перейти к цитате
Автор: Melter163 Перейти к цитате
Эх, надеюсь в скором времени заработает проект. Интересный чёрт возьми и полезный, тем более отечественный

Хорошо, что напомнили. Написал с вопросами, может что-то прояснится.

Ну вот, ответ от одного из организаторов:
Цитата:
Пока проект не развивается, так как на него банально нет времени.
В целом тема интересная, но нужны квалифицированные люди, которые будут над ней работать.

В общем, всё как обычно. Не получается
Offline Melter163  
#19 Оставлено : 24 ноября 2013 г. 20:23:50(UTC)
Melter163


Статус: Частенько заглядывает

Группы: Member
Зарегистрирован: 04.02.2013(UTC)
Сообщений: 276
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: Самара

Сказал «Спасибо»: 105 раз
Поблагодарили: 30 раз в 22 постах
Автор: AlexA Перейти к цитате
Автор: AlexA Перейти к цитате
Автор: Melter163 Перейти к цитате
Эх, надеюсь в скором времени заработает проект. Интересный чёрт возьми и полезный, тем более отечественный

Хорошо, что напомнили. Написал с вопросами, может что-то прояснится.

Ну вот, ответ от одного из организаторов:
Цитата:
Пока проект не развивается, так как на него банально нет времени.
В целом тема интересная, но нужны квалифицированные люди, которые будут над ней работать.

В общем, всё как обычно. Не получается


понятно, короче можно спокойно забыть про этот проект, так как наши как всегда не будут его развивать. То времени нету, то квалифицированных людей нету, то денег, то руки из задницы растут, а у кого то мозги наивного ребёнка. Короче крест над этим проектом.
thanks 1 пользователь поблагодарил Melter163 за этот пост.
ReaDy оставлено 25.11.2013(UTC)
Offline Disel  
#20 Оставлено : 25 ноября 2013 г. 12:53:27(UTC)
Disel


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Нахождение пар ОДЛК в RakeSearch! Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Member, Russia Team Group
Зарегистрирован: 08.07.2013(UTC)
Сообщений: 3,594
Мужчина
Российская Федерация

Сказал «Спасибо»: 516 раз
Поблагодарили: 426 раз в 326 постах
Цитата:
Пока проект не развивается, так как на него банально нет времени.

Наверное заставляют писать не кому не нужную всячину, какие-нибудь отчеты... как обычно, вместо того, что бы заниматься наукой sad
Ubuntu Linux 18.04 LTS - 64 bit / Boinc 7.9.3(х64) / Core 2 DUO E6300 1.8 Ггц / GeForce GT-630
Пользователи, просматривающие эту тему
Guest
Быстрый переход  
Вы не можете создавать новые темы в этом форуме.
Вы не можете отвечать в этом форуме.
Вы не можете удалять Ваши сообщения в этом форуме.
Вы не можете редактировать Ваши сообщения в этом форуме.
Вы не можете создавать опросы в этом форуме.
Вы не можете голосовать в этом форуме.

Boinc.ru theme. Boinc.ru
Форум YAF 2.1.1 | YAF © 2003-2018, Yet Another Forum.NET
Страница сгенерирована за 0.300 секунды.