Российские распределенные вычисления на платформе BOINC
Форум участников распределённых вычислений.

Добро пожаловать, Гость! Чтобы использовать все возможности Вход или Регистрация.

Уведомление

Icon
Error

5 Страницы123>»
Опции
К последнему сообщению К первому непрочитанному
Offline SerVal  
#1 Оставлено : 9 августа 2010 г. 19:11:44(UTC)
SerVal


Статус: Administration

Медали: Донор: За финансовую помощь сайту

Группы: Editors, Administration, Russia Team Group
Зарегистрирован: 28.09.2007(UTC)
Сообщений: 3,065
Мужчина
Откуда: Москва, Ясенево.

Сказал «Спасибо»: 291 раз
Поблагодарили: 516 раз в 358 постах
http://www.lenta.ru/articles/2010/08/06/game/

Игры разума
Геймеры оказались эффективнее суперкомпьютеров в научной работе

В четверг, 5 августа в Nature - одном из самых авторитетных научных журналов - появилась очень необычная статья. Ее авторы (которых более 57 тысяч) представили доказательства того, что геймеры могут быть намного более эффективны в выполнении сложной научной работы, чем самые мощные суперкомпьютеры. Играя в созданную авторами статьи компьютерную игру, пользователи подбирали пространственные структуры белков – то есть выполняли ту задачу, надежного решения которой в современной биологии нет.
thanks 1 пользователь поблагодарил SerVal за этот пост.
tim_50 оставлено 23.04.2011(UTC)
Offline evatutin  
#2 Оставлено : 21 июля 2011 г. 8:30:52(UTC)
evatutin


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@homeРазработчику: За организацию проекта Gerasim@home

Группы: Editors, Member
Зарегистрирован: 08.06.2010(UTC)
Сообщений: 3,389
Откуда: Russia, Kursk

Сказал(а) «Спасибо»: 936 раз
Поблагодарили: 1538 раз в 753 постах

kvt.kurskstu team founder
Gerasim@home scientist
My numbers are 5056994653507584 and 1835082219864832081920. Why not? smile
thanks 2 пользователей поблагодарили evatutin за этот пост.
Vesper оставлено 21.07.2011(UTC), MikeVentris оставлено 27.02.2012(UTC)
Offline Alexone  
#3 Оставлено : 18 января 2012 г. 14:52:03(UTC)
Alexone


Статус: Старожил

Медали: Переводчику: За помощь в развитии сайтаПервооткрывателю: Результат в проекте SAT@home

Группы: Editors, Member, Moderator "We wanna HELP"
Зарегистрирован: 21.10.2010(UTC)
Сообщений: 556
Мужчина
Откуда: Самара

Сказал «Спасибо»: 241 раз
Поблагодарили: 173 раз в 105 постах
Новость от проекта Rosseta@home.
Новость датирована 16 января 2012 года.

Блог Девида Бейкера(David Baker).
В ответ на ваши просьбы, мы решили размещать описания многих научных проблем, которые в скором времени будут решаться с помощью Rosetta @ Home, в новостной ленте. Так что в ближайшие пару недель - следите за новостями! Еще я хочу поделиться с вами информацией о направлении нашего нового исследования, к которому мы приступаем – это новые методы лечения рака. В это исследование входит небольшой набор белков, которые часто находятся в центре (в ядре) раковой клетки, нежели обычно исследуемые белки с поверхности. Мы начинаем проектировать маленькие белки, которые тесно связаны с онкомаркерами. И если мы добьемся успеха, у нас есть сотрудники, которые проведут тестирование этих белков на их способность к целевому уничтожению раковых клеток в опухолях.

Ссылка на оригинал новости.

Отредактировано пользователем 18 января 2012 г. 16:13:42(UTC)  | Причина: Не указана


UserPostedImage
thanks 4 пользователей поблагодарили Alexone за этот пост.
Step оставлено 18.01.2012(UTC), AlexA оставлено 18.01.2012(UTC), MikeVentris оставлено 27.02.2012(UTC), Buzun Sergey оставлено 30.03.2012(UTC)
Offline bronevik  
#4 Оставлено : 30 марта 2012 г. 15:10:30(UTC)
bronevik


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@home

Группы: Member
Зарегистрирован: 11.06.2011(UTC)
Сообщений: 1,174
Мужчина
Откуда: Russia Team, Moscow

Сказал «Спасибо»: 159 раз
Поблагодарили: 261 раз в 156 постах
Сегодня в новостях:

Цитата:

Мы полагаем, что в последние пару месяцев совершили некоторый прорыв в расчете структуры [белка] и с нетерпением ждем возможности проверить новый метод в CASP-10. Нам нужна ваша помощь так как мы тестируем множество аспектов нового подхода и серьезно ограничены в этом текущей производительностью. В очереди все еще очень много заданий для лекарств от гриппа и структурных предсказаний, что мы вынуждены будем ждать 8 дней прежде чем поставить туда новые. Было бы очень здорово временно увеличить долю Розетты на ваших машинах и привлечь новых пользователей, нам бы пригодилась любая помощь.
Спасибо за ваше участие. Доктор Бейкер.




130 терафлопов им мало, буржуи! smile

CASP-10, кто не знает, это соревнование между лабораториями в предсказании структуры белка. Структура предварительно снимается с помощью рентгеновской микроскопии, участникам высылается только последовательность аминокислот. И кто предскажет её точнее, основываясь лишь на этих данных. Насколько я знаю, в этом году из знакомых нам участвуют Розетта и ПОЭМ.
Мое счастливое число 1534157809947*2^1290000-1

UserPostedImage

thanks 3 пользователей поблагодарили bronevik за этот пост.
AlexA оставлено 30.03.2012(UTC), Buzun Sergey оставлено 30.03.2012(UTC), processing-home оставлено 31.03.2012(UTC)
Offline Salmonella  
#5 Оставлено : 31 марта 2012 г. 16:58:36(UTC)
Salmonella


Статус: Давно уж тут

Группы: Member
Зарегистрирован: 30.03.2010(UTC)
Сообщений: 226
Откуда: Россия

Сказал(а) «Спасибо»: 2 раз
Поблагодарили: 80 раз в 47 постах
Автор: bronevik Перейти к цитате
130 терафлопов им мало, буржуи! smile

Ну так игра в угадайку же.smile Чем больше тем лучше.
Вообще это больше похоже на соревнование амер. университетов. Врубят свой TeraGrid и вперёд. Ставлю на Мичиган и Робетту.smile
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/research/
Offline bronevik  
#6 Оставлено : 31 марта 2012 г. 17:06:14(UTC)
bronevik


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@home

Группы: Member
Зарегистрирован: 11.06.2011(UTC)
Сообщений: 1,174
Мужчина
Откуда: Russia Team, Moscow

Сказал «Спасибо»: 159 раз
Поблагодарили: 261 раз в 156 постах
Автор: Salmonella Перейти к цитате
Автор: bronevik Перейти к цитате
130 терафлопов им мало, буржуи! smile

Ну так игра в угадайку же.smile Чем больше тем лучше.
Вообще это больше похоже на соревнование амер. университетов. Врубят свой TeraGrid и вперёд. Ставлю на Мичиган и Робетту.smile
http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/research/

Не все всегда решает мощность. 9 предыдущих CASPов это продемонстировали.
Мое счастливое число 1534157809947*2^1290000-1

UserPostedImage

Offline Salmonella  
#7 Оставлено : 31 марта 2012 г. 18:05:45(UTC)
Salmonella


Статус: Давно уж тут

Группы: Member
Зарегистрирован: 30.03.2010(UTC)
Сообщений: 226
Откуда: Россия

Сказал(а) «Спасибо»: 2 раз
Поблагодарили: 80 раз в 47 постах
Где почитать про мощности?
Offline bronevik  
#8 Оставлено : 31 марта 2012 г. 21:37:15(UTC)
bronevik


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@home

Группы: Member
Зарегистрирован: 11.06.2011(UTC)
Сообщений: 1,174
Мужчина
Откуда: Russia Team, Moscow

Сказал «Спасибо»: 159 раз
Поблагодарили: 261 раз в 156 постах
Автор: Salmonella Перейти к цитате
Где почитать про мощности?

Где-то в недрах Розеттовских Message Boards были отчеты с 8-го и 9-го
Мое счастливое число 1534157809947*2^1290000-1

UserPostedImage

Offline AlexA  
#9 Оставлено : 9 апреля 2012 г. 14:36:27(UTC)
AlexA


Статус: Administration

Медали: Переводчику: За помощь в создании сайта

Группы: Editors, Member, Administration, Russia Team Group, Moderators
Зарегистрирован: 02.10.2007(UTC)
Сообщений: 6,127
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: "Russia Team"

Сказал «Спасибо»: 1221 раз
Поблагодарили: 1506 раз в 832 постах
Попытка взять интервью у руководителя проекта Roseta Дэвида Бейкера окончилась не то, чтобы неудачей, но как-то не оставила никакого удовлетворения. Он, правда ответил на некоторые вопросы (и это несомненный плюс), однако был еще более лаконичен, чем руководитель проекта Einstein Брюс Аллен.
В общем эти ответы никак не тянут на страничку в рубрике "Персона грата", поэтому просто приведу их тут:
Цитата:

1. Какие трудности возникают в работе проекта? (без ответа)
2. Удовлетворены ли Вы числом участников проекта?

Они делают большую работу, но нам требуется гораздо больше!

3. Оправдались ли ваши ожидания от этого проекта? Довольны ли вы результатами?

Да, результаты проекта являются неоценимыми(бесценными ?)[invaluable] для наших исследований

4. Планируете ли Вы продолжать работать над проектом?

да!!

5. В каком направлении планируется развивать проект?

В направлении разработки новых лекарственных препаратов, способных блокировать инфекционные и онкологические заболевания.

6. Что хотели бы Вы желать участникам проекта?

Спасибо за вышу помощь!!
thanks 6 пользователей поблагодарили AlexA за этот пост.
MikeVentris оставлено 09.04.2012(UTC), SerVal оставлено 09.04.2012(UTC), sagip оставлено 09.04.2012(UTC), evatutin оставлено 10.04.2012(UTC), bronevik оставлено 15.04.2012(UTC), Alexone оставлено 27.04.2012(UTC)
Offline bronevik  
#10 Оставлено : 15 апреля 2012 г. 21:03:16(UTC)
bronevik


Статус: Старожил

Медали: Первооткрывателю: Результат в проекте SAT@home

Группы: Member
Зарегистрирован: 11.06.2011(UTC)
Сообщений: 1,174
Мужчина
Откуда: Russia Team, Moscow

Сказал «Спасибо»: 159 раз
Поблагодарили: 261 раз в 156 постах
Пара слов о последней публикации проекта.

Цитата:
Небольние выжимки из статьи (полностью переводить времени нет).
Синтез в пробирке и последующая кристаллография показала, что 3д стуктура практически идеально совпала с разработанной в R@H моделью (все за исключением 1 аминокислотного остатка).
Испытания проводились на изомере циклозарина(тоже один из нервно-паралитических газов) и искомые свойства (которые пытались "запрограммировать"wink подтвердились на практике.
Возможные применения - обеззараживание земель (после массированного применения пестицидом и инсектицидов либо аварий с разливами соотв. веществ) и лечение выживших при применении нервно-паралитических газов фосфорорганической группы.

Осбенность работы (и главное достижение), что в подобных разработках обычно для начала находится уже готовый (природный) энзим имеющий соответствующие свойства (но только очень слабые, недостаточные для практического применения), и путем внесения последовательных изменений ("мутаций"wink проводят его "эволюцию" с целью усилить нужные свойства до нужного (или максимально возможного) уровня.
Слабое место такого подхода - нужно найти такой базовый энзим, во многих случаях такой "базы" просто не существует.
В этой же работе разработка модели велась "с нуля" - базового энзима с нужными (пусть и слабыми) свойствами не было, была только задача - какие свойства нужно получить.
Полученный инзим показал приличную "производительность" в 10 000 молекул/секунду (1 молекула фермента помещенная в целевое вещество "обрабатывает" 10 тыс. целевых молекул в секунду), ускорение течения реакции (по сравнению с естественным распадом) - в 10 млн. раз.

Всего было разработано 12 "перспективных" моделей, которые были синтезированы в пробирке (путем генно-модифицированных бактерий).
Среднее количество мутаций(замен одной аминокислоты на другую) исходных белков-заготовоок от 5 до 15. 6 энзимов оказались либо нерастворимыми в воде(или по каким-то другим причинам синтез белка не происходил несмотря на экспрессию соотвествующего гена) и сразу отбраковались. Еще 6 испытывались на предмет нужных свойств из них и был обнаружен 1 энзим с заданными изначально свойствами. Причем выраженность свойств (см. выше про активность) достаточно сильная, чтобы не просто формально признать успех (и интерес с научной точки зрения), но и в принципе достаточна для практического применения. (результат помещен в открытую базу данных PDB, так что любой желающий при наличии соотв. технологий может брать модель и синтезировать и применять).

Хотя изначальная модель (созданная автоматически в R@H среди других 12) показывала относительно слабые свойства (4 молекулы/сек на 1 молекулу фермента). После чего уже доводили до ума 1 конкретную модель с участием человека (который направлял/подсказывал направление поиска - "управляемая эволюция"wink в результате были созданы следующие ее версии с возраставшей активностью
v0(изначальная модель созданная R@H без вмешательства человека, 8 мутаций/замен в исходном белке "заготовке"wink - 4 молекулы/сек
v1(v0+3 замены) - 154
v2(v1 + еще 3 замены в других точках) - 959
v3(v2+ 1 замена) ~ 10 000


За перевод спасибо MadMax'у из TSC.
Мое счастливое число 1534157809947*2^1290000-1

UserPostedImage

thanks 1 пользователь поблагодарил bronevik за этот пост.
MikeVentris оставлено 15.04.2012(UTC)
Offline MikeVentris  
#11 Оставлено : 15 апреля 2012 г. 21:40:40(UTC)
MikeVentris


Статус: Старожил

Группы: Member
Зарегистрирован: 18.10.2010(UTC)
Сообщений: 512
Мужчина
Откуда: Санкт-Петербург

Сказал «Спасибо»: 79 раз
Поблагодарили: 48 раз в 34 постах
Ого! Вот оно, то, ради чего мы этим занимаемся.
Offline Шмяка  
#12 Оставлено : 15 апреля 2012 г. 21:42:45(UTC)
Шмяка


Статус: Старожил

Медали: Роза: Девчатам от доброго сердца

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 08.02.2012(UTC)
Сообщений: 1,862
Женщина
Российская Федерация
Откуда: Везде, куда ни занесет

Сказала «Спасибо»: 841 раз
Поблагодарили: 438 раз в 238 постах
вот и результат - вакцина от нервно паралитических газов. теперь военные химики взамен этих газов начнут какую нибудь новую дрянь изобретать, чтоб им самим этой дряни по полной ложке.
◕‿‿◕ Мяяяяяу!!! ◕‿‿◕ godville.net/gods/Шмяка ◕‿‿◕ MIUKA.mybrute.com ◕‿‿◕

UserPostedImage

Offline Freddykrug  
#13 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 6:33:24(UTC)
Freddykrug


Статус: Старожил

Группы: Member, Модератор Astronomy.Ru Forum
Зарегистрирован: 30.05.2010(UTC)
Сообщений: 2,860
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Томск

Сказал «Спасибо»: 727 раз
Поблагодарили: 490 раз в 310 постах
«Над чем бы учёные не работали, у них всё равно получается оружие». Курт Воннегут.
Именно поэтому считаю астрономические и математические проекты. (ну, не всегда)
3 Gb Radeon 7950, i-5 2400, 16 Gb ОЗУ Astronomy.Ru Forum

Offline MikeVentris  
#14 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 8:45:13(UTC)
MikeVentris


Статус: Старожил

Группы: Member
Зарегистрирован: 18.10.2010(UTC)
Сообщений: 512
Мужчина
Откуда: Санкт-Петербург

Сказал «Спасибо»: 79 раз
Поблагодарили: 48 раз в 34 постах
А чего в этом плохого? smile Люди придумали ядерное оружие, а затем мирный атом. Баллистические ракеты, а затем полетели на них в космос. Компьютеры, использующиеся в военных целях, а затем персональные компьютеры. Сеть для связи военных, а затем Интернет. Гонка вооружения - самый сильный толчок для прогресса, то, чего сейчас не хватает. Да и от инопланетян когда-нибудь чем-нибудь придется защищаться welcome
Offline Freddykrug  
#15 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 8:49:34(UTC)
Freddykrug


Статус: Старожил

Группы: Member, Модератор Astronomy.Ru Forum
Зарегистрирован: 30.05.2010(UTC)
Сообщений: 2,860
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Томск

Сказал «Спасибо»: 727 раз
Поблагодарили: 490 раз в 310 постах
Это вы ему расскажите про благость прогресса гонки вооружений. Думаю, он вас поймет:

UserPostedImage
3 Gb Radeon 7950, i-5 2400, 16 Gb ОЗУ Astronomy.Ru Forum

Offline Шмяка  
#16 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 9:21:31(UTC)
Шмяка


Статус: Старожил

Медали: Роза: Девчатам от доброго сердца

Группы: Member, Crystal Dream Group
Зарегистрирован: 08.02.2012(UTC)
Сообщений: 1,862
Женщина
Российская Федерация
Откуда: Везде, куда ни занесет

Сказала «Спасибо»: 841 раз
Поблагодарили: 438 раз в 238 постах
фууууу.. крюгги где ты это взял у меня аж ноутбук завис...
◕‿‿◕ Мяяяяяу!!! ◕‿‿◕ godville.net/gods/Шмяка ◕‿‿◕ MIUKA.mybrute.com ◕‿‿◕

UserPostedImage

Offline MikeVentris  
#17 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 9:31:03(UTC)
MikeVentris


Статус: Старожил

Группы: Member
Зарегистрирован: 18.10.2010(UTC)
Сообщений: 512
Мужчина
Откуда: Санкт-Петербург

Сказал «Спасибо»: 79 раз
Поблагодарили: 48 раз в 34 постах
Автор: Freddykrug Перейти к цитате
Это вы ему расскажите про благость прогресса гонки вооружений. Думаю, он вас поймет:

UserPostedImage

А хто это вообще такой? И как он связан с прогрессом?
Offline Freddykrug  
#18 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 9:32:03(UTC)
Freddykrug


Статус: Старожил

Группы: Member, Модератор Astronomy.Ru Forum
Зарегистрирован: 30.05.2010(UTC)
Сообщений: 2,860
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: г. Томск

Сказал «Спасибо»: 727 раз
Поблагодарили: 490 раз в 310 постах
Отсюда Это жертва атомной бомбардировки Хиросимы.
Про Циклон-Б (гитлеровская Германия) и оранж (война США во Вьетнаме) только упомяну.
Цитата:
По данным вьетнамского Общества пострадавших от диоксина, из трёх миллионов вьетнамцев — жертв химиката к настоящему времени свыше миллиона человек в возрасте до 18 лет стали инвалидами, страдающими наследственными заболеваниями.

3 Gb Radeon 7950, i-5 2400, 16 Gb ОЗУ Astronomy.Ru Forum

Offline Thirteenth  
#19 Оставлено : 16 апреля 2012 г. 10:07:55(UTC)
Thirteenth


Статус: Частенько заглядывает

Группы: Member
Зарегистрирован: 07.02.2012(UTC)
Сообщений: 165
Мужчина
Откуда: Russia, Kemerovo

Сказал «Спасибо»: 24 раз
Поблагодарили: 26 раз в 16 постах
Автор: Freddykrug Перейти к цитате
Отсюда Это жертва атомной бомбардировки Хиросимы.


А человечество по-другому пока не умеет. Чтоб одни пользовались благами цивилизации, другие (как этот мученик) должны сначала на себе испытать военный вариант этих "благ"...
Home: Pentium E6800 / GTX560Ti 448 cores / GTS450
thanks 1 пользователь поблагодарил Thirteenth за этот пост.
MikeVentris оставлено 16.04.2012(UTC)
Offline Escapist_Russia  
#20 Оставлено : 1 мая 2012 г. 8:40:35(UTC)
Escapist_Russia


Статус: Частенько заглядывает

Группы: Member
Зарегистрирован: 04.09.2011(UTC)
Сообщений: 217
Мужчина
Российская Федерация
Откуда: Подольск

Сказал «Спасибо»: 125 раз
Поблагодарили: 39 раз в 26 постах
У меня уже третье задание подряд вылетает с ошибкой вычислений где-то после 15 % подсчета...есть у кого-нибудь подобная проблема?
P.S. производил обновление boinc до 7 версии, с заданиями остальных проектов - нет проблем
Пользователи, просматривающие эту тему
Guest
5 Страницы123>»
Быстрый переход  
Вы не можете создавать новые темы в этом форуме.
Вы не можете отвечать в этом форуме.
Вы не можете удалять Ваши сообщения в этом форуме.
Вы не можете редактировать Ваши сообщения в этом форуме.
Вы не можете создавать опросы в этом форуме.
Вы не можете голосовать в этом форуме.

Boinc.ru theme. Boinc.ru
Форум YAF 2.1.1 | YAF © 2003-2017, Yet Another Forum.NET
Страница сгенерирована за 0.346 секунды.